Летом 1997 г., когда была организована Лютеранская Богословская Семинария, начала работать и библиотека Семинарии. Фактически, к сбору фондов приступили ещё в июле до начала первого учебного года. Первоначально покупкой и подбором книг занимался ректор семинарии, поскольку в штате ещё не было библиотекаря. Пока строительство здания семинарии не было завершено, в роли хранилища книг выступала квартира ректора, где книги стояли на шкафах и в любом свободном месте. Это, естественно, означало, что на первых порах студенты не могли ими пользоваться, хотя в самом начале программы во время изучения библейских языков особых нужд в дополнительных книгах и не возникало.

Самым большим импульсом первоначального развития библиотеки стала поездка о. Алексея в Москву и Петербург в августе 1997 года специально для закупки больших партий книг. В поездке его любезно согласился сопровождать о. Всеволод Лыткин, который разделил все тяготы первых книжных приобретений. В то время заказ книг по Интернету ещё не был доступен в России, а традиционная советская система «Книга - почтой» уже не функционировала нормально из-за нарушения связей регионов с центром и появления большого числа небольших автономных издательств. Фактически, многие книги надо было искать только в книжных лавках, магазинах и на оптовых книжных базах. Поскольку далеко не все книги доходили до Новосибирска, такая поездка стала необходимой. В течение поездки были закуплены сотни книг, что даже вызвало трудности при погрузке в поезд и позднее, при посадке в самолёт.

В декабре 1997, когда состоялся торжественный переезд в первое здание семинарии - трёхэтажный коттедж недалеко от деревни Благовещенка, библиотека «ожила». Рост библиотеки превысил все ожидания, и очень скоро заказанных изначально под библиотеку книжных стеллажей стало не хватать, в результате чего, пришлось искать место для размещения книг по всему зданию.

Хотя библиотека всегда была одним из важнейших приоритетов развития семинарии, заниматься целенаправленно её планомерным развитием было нелегко из-за большой общей занятости. После ректора библиотекой в разное время занимались А. Черкашин и И. Андреюк, но у них так же были и другие обязанности помимо развития библиотеки.

Тем не менее, в это время библиотека ЛБС стала выписывать периодические издания, и книги были более тщательно рассортированы по разделам в старом здании семинарии. Учебный год, начавшийся в 2000 году, принёс с собой новые перемены - на должность библиотекаря был назначен Артём Литвинов, окончивший перед этим Теологическую Семинарию Конкордия в Форт-Уэйне (США). Он начал работу над всеобщей каталогизацией имеющихся материалов и подготавливал последующий переезд библиотеки в новое просторное здание семинарии в Академгородке.

Все книги были зарегистрированы в электронной базе данных с полной информацией о каждом экземпляре; также был организован электронный учёт выдачи-приёмки книг читателям. В новом здании библиотека получила 3 помещения для размещения книг, одно из которых используется как хранилище для книг, не входящих в основной фонд. В основном помещении библиотеки находится рабочее место библиотекаря. Ещё одно помещение - читальный зал, где кроме мест для самостоятельной работы с литературой, размещены периодические издания и материалы по языкознанию и философии. В связи с постоянным притоком новых книг, планируется переместить учебные места из читального зала в другую комнату, а освободившееся пространство отдать под новые поступления.

В настоящее время библиотека ЛБС продолжает динамично развиваться, регулярно получая книги и периодику, изданные не только в России, но и в других странах. По количеству и разнообразию фондов богословской литературы наша библиотека занимает одно из первых мест в Новосибирске. Сейчас в ней больше 8 тысяч наименований. Весь фонд составляет около 11 тыс. экземпляров.

Современные технологии не обходят стороной как семинарию, так и её библиотеку. Студенты, имеют доступ к электронной почте и электронному поиску материалов. Обсуждается вопрос о предоставлении студентам полномасштабного круглосуточного доступа к Интернет по выделенной линии, это особенно актуально для семинаристов старших курсов, которым нужно писать курсовые и дипломные работы.